虽然潘基文赢得轻松，但他也不是受到所有人的喜欢，根据《 日本经济新闻 》 的报道，在第四轮意向性投票中，惟一没有投赞成票的国家就是日本，日本外务省对此也已经默认。中央党校国际战略研究所世界经济研究室主任陈江生教授说： “韩日的政治关系一直都比较紧张，所以对潘基文一直都没有明确表态。但最后还是投了赞成票，这是一个利益关系妥协的结果。区域趋同性和区域经济一体化使韩日拥有更多的共同利益。”
路透社援引一名外交官的话说： “他是个好人，但一些人担心，潘基文是否有能力面对联合国经常出现的激烈场面：美国人在一只耳朵里大吵大闹，而第三世界国家在另一边抗议。”
面对种种怀疑和难题，潘基文坦言秘书长一职任务艰巨，不过，他在接受美联社采访时也颇为自信地说：“这不是一项简单的工作。有时候，我看起来会像一个温和的领导人，但我具有内在的力量，这就是其他国家一般难以看到的东西，也是我们比较看重的美德——温和、谦逊。”
2006年5月，潘基文在与10余家世界级媒体举行座谈会时，首度阐述了他将如何领导联合国。
潘基文在座谈会上说：“我领导的联合国要实现安南秘书长既定的目标，而非提出新的设想，说白了就是要采取措施实现联合国的三大核心目标——和平与安全、发展、人权。为了实现这三大核心目标，我要优先做五件事。”
潘基文要做的第一件事是：出台联合国反恐公约。潘基文在座谈会上感慨地回顾说：“恐怖主义仍是当今世界的最大威胁，联合国要出台切实可行的国际反恐公约。有了联合国反恐公约，可以避免某些大国打着反恐的幌子谋求国家利益，可以避免某些大国打着反恐的幌子侵犯人权，可以避免某些大国打着反恐的幌子不尊重联合国。”
潘基文要做的第二件事是：让联合国的“和平重建委会员”展开工作。潘基文表示，联合国“和平重建委员会”很长时间里是说的多做的少，“大话多做的实事少”。他的打算是确定联合国和平重建行动的模式与范畴，明确委员会工作人员的具体任务，保证委员会能展开工作，“而不是拿着联合国发的薪水，成天坐在纽约办公室里上上网，发发电子邮件，动动嘴皮子，最多乘包机跑到哪个国家晃一圈”。
潘基文要做的第三件事是：怎样更好地使联合国的维和行动贯彻人道主义原则。潘基文认为，联合国维和行动要“急人所急”，以最高的道德标准与职业水平展开行动。
潘基文要做的第四件事是：落实联合国发展纲要。新千年开始之时，联合国提出了千年发展目标：在2015年前将全球极端贫困人口减半、加强妇幼保健、普及基础教育、促进性别平等、制止环境恶化等等。潘基文说，日期临近，联合国“应该实现当着全世界的面做出的承诺”。他说：“要动员联合国成员国增加发展援助，从而令国际社会相信：联合国说到做到。”
潘基文要做的第五件事是：怎样使新的联合国人道主义委员会满足国际社会更高的人道主义要求。潘基文表示，包括韩国在内的联合国人道主义委员会成员国应该团结一致向前走，确保人的尊严与更大的自由。
关于处理大国关系，潘基文说：“美国和韩国是亲密盟友，保持着极好的安全、经济与社会关系，这种关系已经保持了50多年，而中国与韩国之间的关系非常重要，特别是经济以及文化之间的交流，因此，虽然
中韩之间的关系非常‘年轻’，但却很有分量。”
潘基文在谈到未来时愉快地说：“对于新职位，我是这么想的，秘书长秘书长，先是‘秘书’，然后才是‘长’。联合国秘书长其实是一位总协调员，既要懂领导，又得会协调。而我要协调好成员国之间的关系，就得了解192个成员国之间的差异。我可以向大家保证的是，我一定会以最平易近人的态度听取关于联合国改革的意见，并且确保联合国日常运作的顺畅。我希望成为一位踏踏实实做事的‘掌门人’。”他表示，联合国改革将是他最重要的关注点。“首先，我会先改革秘书处。它因效率低下备受批评，甚至还卷入了腐败丑闻。我要提高它的士气和专业化。我会引入一个能使工作得到客观评估的体系。其次，我会努力消除联合国中（尤其是）发展中国家和发达国家之间的不和。我将扮演一个协调者的角色。”
关于联合国新的人事安排，潘基文说：“我正在考虑加强女性在联合国的地位。”他说：“我本人认为，联合国是提升女性社会地位的重要国际机构。2000年时我提出韩国国会里女性要成为‘半边天’，尽管现在这个目标还远没有达到，韩国国会里女性议员的比例很低，但我们会一直努力。”
关于女性在联合国的地位，他表示：“如果从低一点的行政级别来看，女性在这些级别的雇员人数中所占的比例高达60％，而行政级别越高，女性雇员的比例越低。我的设想是联合国高层中女性所占的比例能达到50％，不知道这需要多长时间，但不管怎么样我会努力的。”
他说：“对于一些特定的问题，秘书长也有其限制。现实就是这样。但是秘书长作为全世界的首席外交官，应该做出公正、高超、灵活的外交努力，扮演调停人的角色。”
潘基文给自己确定了众多目标，而他实现这些目标的独门秘笈则是“太极智慧”。他说：“太极的玄妙在于有效地化解激烈的冲突，用到国际热点问题上很有效。只有作为东方人的我才能理解太极的玄妙。”
中国先哲老子《 道德经 》 中说：“天下之至柔，驰骋天下之至坚。”
潘基文给人的印象是柔弱如水，而“至柔”的水，却能在“至坚”之中左右逢源，水滴石穿。许多人也看好潘基文的这一“太极智慧”。
韩国外交通商部表示，认为潘基文很“软弱”的看法是一种误解。一位资深韩国外交官说：“在东方文化中，领导能力的高低有不同的判定标准。也许一个人看上去很和蔼可亲、文质彬彬，但实际上他的内心深处有强硬的一面……外表是一回事，他的坚强信念以及随时准备作出困难决定的决心又是另一回事。”
日本崎玉大学韩国问题专家吉田康彦说：“潘基文也许缺乏改革联合国的韧劲，但这也是他被选择的原因……一个外表软弱的人是最合适的人选。潘基文最好的角色不是一个领导者，而是一个各种观点的协调者。”
耶鲁大学国际历史系教授保罗·肯尼迪也认为，现在匆匆断定下任联合国秘书长将碌碌无为还为时过早。“一条金科玉律就是：联合国不需要一个充满争议的人，一个在执行政策时经常得到一些国家支持，另一方面又冒犯其他国家的人。”保罗·肯尼迪认为，潘基文得到了美国和中国的支持，工作起来应该比较“开心”。美国一直倾向于推动干涉主义，而中国一直反对干涉别国内政。“想要弥补这样的分歧，就需要一个各方都信任的人。”
中国国务院发展研究中心亚非发展特约研究员张琏瑰教授也对潘基文的“软弱”提出自己的看法：“我不认为这一定就是缺点，一个弱势的、或者完全保持中立的秘书长，也许更有利于大国关系的调和。”有学者指出，当今世界所面临的很多重大问题，都是现有国际力量和模式所不能解决的。特别是在反恐战争之后，伊斯兰文明与基督教文明之间的某种不信任和敌意日益加深。因此，目前的国际体系需要注入崭新的智慧、崭新的哲学思考和行为模式。世界上的冲突已经够多，现在最需要的不是强悍和锋芒毕露，而是外柔内刚、善于走中庸之道的斡旋者与调解者。或许，潘基文正是这样一个合适的人选。
《 金融时报 》说：“潘基文在竞选过程中没有惊人之举，这并不意味着他上任后也会是这样。瑞典人哈马舍尔德刚开始的时候是无名之辈，相反两位高调登场的人瓦尔德海姆和加利未能功成名就。”
人们也将潘基文和安南以及其他前任作了比较。
潘基文行事一向低调，这与安南形成反差。安南经常高调出现，被戏称为外交界的“摇滚歌星”。而不少联合国官员，尤其是美国常驻联合国代表博尔顿，似乎更希望联合国秘书长在全球事务中以“低调管理者”的姿态出现。一些联合国官员相信，对联合国一直“不怀好意”的布什政府还在为安南反对伊拉克战争感到不悦，因此美国需要一位“尽可能软弱的”秘书长。
尽管安南常常受到美国的抨击，但欧洲国家更欣赏他。荷兰克林根代尔国际关系研究所的联合国问题专家迪克·路迪吉克说，潘基文“不会是那种积极而善于采取主动的外交官，而这种特征我们在安南身上能够看到”。
“我认为，他（潘基文）会像他的亚洲前任吴丹那样，只会小心翼翼地‘看守店铺’。”路迪吉克说。出生于缅甸的吴丹1961～1971年间任联合国第三任秘书长。
《 泰晤士报 》一篇文章说：“联合国秘书长通常有两类：他们要么是达格·哈马舍尔德那样高大的英雄，要么是善意、安分守己的官僚。潘基文属于后 一种。”
国际危机研究组织首尔办事处负责人彼得·贝克说：“他（潘基文） 能干、清廉、谨慎，这些都是一位理想的联合国秘书长应当具备的品质。但是，无论是担任韩国外交通商部长官期间还是更早的时候，他都没有做过任何能使自己扬名的事。他还没有取得过任何实实在在的功绩。”
一名见过潘基文数次的官员评价潘基文说：“他缺乏个性，感召力不强。尽管有各种问题，但安南表现出的是一个有尊严、有政治远见和丰富的国际经验的人。” “世纪基金会”资深研究员Jeffrey Laurenti说，安南已经给后任、作为全球民众代言人的联合国秘书长，留下了很高的门槛。
尽管安南在任上获得了2001年度诺贝尔和平奖，但舆论仍然给了即将离任的他一个如此简洁的评价：“无助的绅士”。安南自己也承认：“我计划雄心勃勃，有人也许会说它过于雄心勃勃。”壮志未酬的他给了继任者一个忠告：“他们一定要脸皮厚，有幽默感，对内、对外都要保持笑脸，尤其应该学会对自己笑。
他们应该能够与世界各地的领导人交往，并保证工作效率。”问题在于，看上去文质彬彬、温文尔雅的潘基文能有那么厚的脸皮吗？
与经常眉头紧锁、一脸严肃的安南相比，潘基文总是笑容可掬，这似乎使他更具亲和力。潘基文在韩国的几乎每一位同僚都认为他很乐观，而且勤奋。韩国前任总统助理、现任议员金善民对路透社表示：“（秘书长一职）他会干得很不错。很难想像有什么能难得倒他。”
而一位不愿透露姓名的联合国高级外交官则说：“我认为潘基文真正具有深厚的外交经验，但他需要学习怎么与媒体打交道。”
老子说：“图难于其易，为大于其细；天下难事，必作于易，天下大事，必作于细。”又说：“治大国，若烹小鲜。”
作为事事亲历亲为、内柔外刚、善于协调、冷静果断以及经验丰富的潘基文，能否将一个全新的联合国展现在世界面前？潘基文的秘书长之路将富于挑战，因而也更让人期待。
2006年是联合国成立61年，62岁的潘基文差不多与它同龄。10月24日是联合国日，是纪念《 联合国宪章 》生效61周年的日子。安南秘书长在10月23日发表他任内第10次、也是最后一次纪念联合国日的讲话，向全世界的朋友和同事致以最美好的祝愿，并呼吁各国支持他的继任者。
安南说，他的职业生涯大部分在为联合国工作，因此联合国日以及联合国所代表的价值对他有特殊意义。他在回顾10年工作时指出，在促进发展、安全和人权方面，国际社会共同努力取得了长足进步，但仍然还有很多工作要做。
关于未来还应努力的方面，安南指出，贫富悬殊继续扩大，很少有国家走上了实现全部八个千年发展目标的正确道路，许多国家的人民仍经历着暴行、压迫和残酷的冲突，核不扩散机制急需关注，恐怖主义和对恐怖主义的反应正在到处散播着恐惧和疑虑。
安南无疑给潘基文留下了许多棘手的考题。
安南在致辞最后高呼：“我们的星球和人民万岁！”“联合国万岁！”与安南的慷慨激昂相比，低调的潘基文在另一场合谈到年满花甲的联合国时则说得很平实。他说：几十年的风风雨雨使他看到过联合国的成功，也看到过联合国的失败，尽管有许多人对联合国感到沮丧，但他总是试图说服自己不要对联合国失去希望。他说作为一个秘书长，他将试图让年轻人知道，联合国正在为他们创造一个更加美好的未来。
潘基文将从2007年1月1日开始自己为期5年的秘书长任期。2006年10月23日，韩国政府举行临时国务会议，通过了对下一任联合国秘书长潘基文提供8。44亿韩元活动经费的预算案。这些经费将用于潘基文就任联合国秘书长前的各种活动开支，包括他邀请外宾、访问其他国家所需要的费用等。除此之外，这些钱还将用于潘基文交接外长职务的开销以及前往联合国就任秘书长的旅费等。
10月27日，潘基文到中国访问。这是他作为候任联合国秘书长，为感
谢联合国5个安理会常任理事国在秘书长选举过程中给予的支持而进行的答谢之旅的第一站。由于他是下届联合国秘书长，中国政府对此提高了接待礼遇，按照政府首脑的规格接待。
中国国家主席胡锦涛在北京人民大会堂会见了潘基文。胡锦涛祝贺潘基文当选联合国秘书长。他说，联合国正处在一个重要的历史时期，随着全球性挑战和威胁不断上升，各国都对联合国寄予厚望。主张多边主义，维护《 联合国宪章 》 的宗旨和原则，加强联合国作用，已成为国际社会的广泛共识。胡主席称“相信潘长官有智慧和能力使联合国发挥更大的作用”。为接待这位候任联合国秘书长，中国政府还特地将驻联合国代表王光亚临时召回国，在会谈时陪同。