白彦虎听说湘军大举出动，还在搞兵屯，大为恐慌。他率部从红庙移驻古牧地，联合当地回民马明的部队抵抗湘军。他们剔发改服，暗中依附安集延人。安集延人也派缠头回民助战。
刘锦棠经过侦察，发现阜康城西水洼纵横，绵延二十里，可以疏通荒废的渠道，供给饮用水。从这里向戈壁走出五十里，直达黑沟驿，才有泉水。
8月8日，刘锦棠令部队开沟引水，靠着废渠扎营。第二天，部队开往戈壁，假装挖井，以使敌人放松警惕。
刘锦棠与金顺约定，当晚出兵偷袭黄田，攻破敌军关卡。
夜幕降临，古牧方向远远地传来号角声，刘锦棠和金顺所部先占据山冈，余虎恩和黄万鹏等人的骑兵从山上冲下，与白彦虎的骑兵厮杀。鏖战良久，白彦虎派步兵增援，谭拔萃、谭上连和董福祥等人的步兵从中路杀出，骑兵分左右包抄，大败白彦虎部，驻防关卡的部队全部逃走。湘军直抵古牧。
刘锦棠认为古牧城防御坚固，很难迅速攻破，便率部返回黄田驻扎。古牧的回民首领马明被帕夏抓住，押往南路，玉治和金中万率领当地回民坚守古牧。
刘锦棠于8月12日挥师包围古牧地，帕夏派军官阿托爱率领骑兵赶来增援。刘锦棠令余虎恩率骑兵在山前伫立，严阵以待。又派步兵分头攻打山垒南关，全部攻克。阿托爱弃马逃走。
8月16日，刘锦棠令部队将开花炮抬来攻城，将城墙垛堞轰塌大半。8月17日，湘军一鼓作气攻克古牧，全歼六千名守军。
刘锦棠估计乌鲁木齐的守军将会逃走，于8月18日亲自率部向乌鲁木齐开进。抵达城东时，发现安集延部、当地回民和缠头回民全部在头天夜里撤走，于是湘军进占乌鲁木齐迪化州及妥明下令建筑的伪王城。
刘锦棠调兵遣将，令各部分头追出三十里，到达盐池，为戈壁所阻，各部返回。
湘军的一系列进攻，令白彦虎和帕夏的部队闻风丧胆。昌吉、呼图壁和玛纳斯的守军都弃城逃走。帕夏派来增援的五千骑兵已到达坂城，距乌鲁木齐二百里，听说友军失败，不敢推进。新疆北路略为安定，只有玛纳斯南城尚未攻克。
清廷收到捷报，赏刘锦棠骑都尉世职，赏谭上连、谭拔萃和余虎恩等人云骑尉世职，黄万鹏赏穿黄马褂，其他将领都得到不同程度奖赏。
左宗棠见新疆北路已经扫清，于9月份要求金顺和锡纶率部分别扼守各城堡要隘，搜查敌军残部，命令张曜、徐占彪与刘锦棠率部向南路进军。
刘锦棠下令搜山，陶生林与谭和义等部奔向东山，黄万鹏、谭上连、谭拔萃和余虎恩等部奔向大池和小池，向东南发展，抵达柴窝堡，小有斩获。
这时候，帕夏率部占据吐鲁番西南侧的托克逊，修筑三座城堡自卫。托克逊是噶孙的军营，北守达坂，就能阻击刘锦棠的乌鲁木齐部队，东守吐鲁番，就能阻击张曜的哈密部队。
从乌鲁木齐撤出的败军，在达坂集结，白彦虎和于小虎的部队占据南山小东沟，派兵四处割禾，准备干粮，企图绕到湘军后方攻击。
刘锦棠于8月28日率部奔向小东沟，白彦虎所部已于前一天奔向金口峡。第二天，刘锦棠部急行军九十里，在金口峡追到白彦虎部。只见几万名老弱妇女，踉跄奔走，惊魂不定。白彦虎和于小虎已率部并入托克逊。刘锦棠回师乌鲁木齐。
帕夏见白彦虎和于小虎势力日渐衰弱，开始对他们颐指气使，勒令他们的部众剃发改装，傍靠他修建的三座城堡居住。
左宗棠令张曜的嵩武军西进，取道七克台，向吐鲁番以东的辟展进军。令徐占彪的蜀军搜索巴里坤和古城一带的各山，从木垒河出兵，与张曜所部夹攻吐鲁番。
木垒河地势宽阔，可以容纳一万骑兵，而且水草丰饶。雍正年间，岳钟琪上奏，说在这里驻扎重兵，必定有效。
金顺所部正在攻打玛纳斯南城，久攻不克，要求湘军助攻。刘锦棠于10月份派出道员罗长祜与谭拔萃、黄万鹏、董福祥等部的十一个营前往。左宗棠见刘锦棠兵力单薄，增派总兵章洪胜、方友升和桂锡桢等部归他调遣。11月上旬，又奏调金运昌军五千人从包头长驱西进，协助刘锦棠。
金顺和锡纶所部于11月17日会同湘军攻克了玛纳斯南城，俘虏伪元帅海玉、马受和马有才等人，妥明手下的悍将都被歼灭。
金顺于12月份率部移驻昌吉，令提督孔才所部驻扎玛纳斯，令方春发所部驻扎呼图壁，令副将徐学功等部分别驻守北路要害，湘军罗长祜等部返回乌鲁木齐。
此后大雪封山，左宗棠各部无法越岭南下。帕夏和白彦虎趁着这个休战的间隙，率部转移到达坂和新城两山之间，派大通哈守卫。
所谓大通哈，就是大总管的意思。
吐鲁番过去有满汉两城。帕夏的次子海古拉又每天驱策万夫修造伪王府，雄阔异常。整个冬天，帕夏令白彦虎和马人得所部驻守吐鲁番，海古拉所部驻守托克逊，大通哈率部驻守达坂，他自己住在西南方向的喀喇沙尔，即现在所说的焉耆，为三路策应。
这一年，慈利人孙开华奉命督师东渡，抵达台湾，屯驻基隆，镇摄台北。当时台湾反清的土著暴动者主要在后山，有阿绵社和纳纳社。孙开华率部抵达成广澳，进驻水母丁。
孙开华所部先取纳纳社，然后进攻阿绵社，擒杀暴动首领马腰兵等人。暴动平息后，清廷对孙开华赏穿黄马褂。
1877年，光绪三年（1）
383
杨乃武与小白菜一案的复审，历时四年，终于案情大白：杨乃武与小白菜是冤枉的。三堂会审之后，杨昌濬又用重金贿赂刑部尚书皂保，企图阻挠平反。
左宗棠这个旧部将领于3月份被清廷革职。这起冤狱的平反，直接导致了官场大地震，江浙地区一百多位官员的顶戴花翎全部摘掉，永不叙用，因军功而入官的湘系军阀受到沉重打击。
至于被告杨乃武，人未亡家已破，连回家的路费都是胡雪岩资助的。他伤筋折骨，几乎成了残废，回到家乡后心灰意冷，轻易不与外界交往，专心研究孵育蚕种。三年之后，培育出了一个蚕种品牌：“风采牡丹，杨乃武记”，家道中兴。
另一名被告小白菜出家为尼，从此在青灯古佛旁了却余生。
杨昌濬在整个审案过程中，一力阻挠平反，竭力维持原判，主要是受了下属的蒙骗，而且也有政治上的考虑。为了筹饷的顺利进行，他必须维护浙江官场中湘军集团的利益。到了最后关头，他为了保住关系网，使出了行贿的下策。
他的这段劣迹被人们编成了戏曲，题名为《杨乃武与小白菜》，广为传播，令杨昌濬不齿于舆论，抬不起头来。
在此之前，左宗棠非常体谅杨昌濬的处境，不愿把他继续留在官场，承受压力，所以劝他放弃官职，不要再为楚军西征筹饷而苦苦煎熬了。但是，杨昌濬两次辞官，清廷都不批准，直到将他革职。
这桩冤案平反以后，左宗棠对杨昌濬没有过多指责，只是直率地要求他“引咎自责”。不过，左宗棠“恭读圣谕”之后，发现清廷除了平反冤案，对杨昌濬并“无诘责之词”，很是欣慰。而且，左宗棠对于这件案子的审结，仍然有所保留。他说，他翻遍了《洗冤录》，并未发现中毒而死的人，可以从骨头的颜色来分辨查验。那么这次验尸官的尸检报告，以及刑讯官员定案的依据，存在可疑之处。
当然，左宗棠没有打算在这件事上纠缠。他劝杨昌濬趁机辞官返乡，不要到条件艰苦的陕甘来受罪，可见他对杨昌濬仍然是非常包容和爱护的。
杨昌濬终于卸任归家了。左宗棠从朋友的来信中得知，杨昌濬仍然非常平和，不喜不怒，左宗棠赞赏地说，从这件事，足以看出杨昌濬的“学者襟抱”。
左宗棠还听到一种传言，说杨乃武一案重审时，死者的尸体被人调换了。他说，如果这个传言属实，那么舞弊比“舞文”更为恶劣，由此而感叹当局者为何如此昏聩。
新疆的冰冻在4月份消解。刘锦棠率部从乌鲁木齐翻过山岭，攻击达坂。张曜率部从哈密西进，先派提督孙金彪所部与徐占彪所部在盐池会师，然后奔赴吐鲁番。
刘锦棠所部在4月16日抵达柴窝，留下部队驻守。
柴窝距离达坂只有二十里。当夜初鼓时分，刘锦棠令部队衔枚疾走，要求在五鼓时分集结于达坂城下。
帕夏的大通哈刚刚引来湖水屏卫达坂城，道路泥深，战马腿陷泥中，直到马腹。余虎恩、陶生林和夏辛酉等部骑兵掠过深淖，在城左山冈列队。谭上达、谭和义和戴宏胜等人率步兵在城后山阿摆开阵势。降将崔伟等部骑兵弥补缝隙。
帕夏的部队还在睡觉，没有发觉湘军到来。天明雾散，城内守军看见了湘军，方始大惊，向城下发射西洋枪炮，从7点到11点，连续射击。湘军小有伤亡，但屹立不动。
刘锦棠策马绕城，观察城濠，坐骑中枪，换马再巡，命令各营修筑壁垒，挖掘濠沟，围困守军。
4月18日，湘军傍靠城东修筑炮台。帕夏次子海古拉派骑兵轮番进攻增援。陶生林等部在隘口拦截，分左右包抄，海古拉的骑兵全部撤走。
城内守军盼不来援军，商议突围逃跑。刘锦棠叮嘱各部严阵戒备。
4月19日，侯名贵所部抬来三尊开花炮，安置炮台，连环轰击，炸塌大部分墙身。不久，炮火击中守军的火药库，屋瓦砖石齐飞。大风骤起，火势蔓延，引烧开花子弹，城中发生大爆炸，炸得人马碎裂。
守军乱成一团，夺门逃走，被湘军堵住，无法出城。刘锦棠令人呼喊：“捆绑穿异装者有赏！”部队奋力擒拿守军将领，将大小头目全部绑到刘锦棠麾下，无一逃脱。
湘军攻克了达坂城，俘虏了守军首领爱伊德尔呼里，也就是安集延人所说的大通哈。还抓获六名胖色提和六名玉子巴什。胖色提翻译成汉语，是营官的意思。玉子巴什则是哨官。还有其他许多军官，其称呼相当于汉语的管理、执事和什长之类。txt电子书分享平台
1877年，光绪三年（2）
大通哈和几个胖色提被捕后，都代帕夏请求投降，愿意绑缚白彦虎献给湘军，并献出南八城赎罪。刘锦棠让他们写信召帕夏来达坂，释放几千名安集延人以及南八城缠头、回民和土尔扈特人，不予处死。全部发给粮食和衣服，放他们返回原部。这些俘虏无不欢欣。
4月25日，刘锦棠率部进驻达坂东南方几十里的白杨河，听说嵩武军孙金彪部和徐占彪部已经攻下七克台，进攻辟展，以及鲁克沁、连木沁台和胜金台等地，将城垒全部攻破。两军在哈拉和卓会师，距离湘军所在只有两日路程。
徐占彪和孙金彪于4月26日领军抵达吐鲁番，得知白彦虎在前一天已率部逃到城东。他们见守军殊死抵抗，便指挥骑兵从两旁抄袭，打乱守军阵势，追赶到城边。城内守军全部出战，与攻城部队杀成一团。
激战正酣时，罗长祜率领湘军杀到，合力攻击，将守军杀得向西奔逃。马人得率部参见嵩武军投降，一万多名缠头和回民跪地求饶。孙金彪下令将他们全部释放，不得诛杀。于是三支部队攻克吐鲁番满汉两城，分兵驻守。
同一天，刘锦棠率部向南急驰一百多里，抵达托克逊，得知海古拉也已闻风逃走。守军在城外与湘军交战，溃败时点火焚烧粮药，弃城逃走。
刘锦棠派部队进城灭火，二万多名缠头和回民跪在马前投降。刘锦棠令他们交出马匹和武器，听候安插。于是湘军攻克托克逊三城。
黄万鹏所部开抵小草湖，遇到白彦虎所部埋伏，被重重包围。两军正在激战，刘锦棠率大部队来到，于是湘军内外夹击，大败白彦虎部。黄万鹏得赏云骑尉世职。
自从清军攻克吐鲁番以后，新疆南八城门户洞开，帕夏日夜忧惶哭泣，茫然不知所措。白彦虎趁机令部属抢掠人畜，焚烧村堡，胁迫缠头和回民一同奔走，引起怨愤。
一方面，白彦虎引起民怨，而帕夏素来虐待缠头和回民，深为大家痛恨；另一方面，湘军和嵩武军对于达坂、托克逊和吐鲁番投降的帕夏部众，全部释放，不予追究，安集延人和回民不再疑惧，互相转告。于是，南八城百姓都引颈盼望湘军将他们救出水火，惩处帕夏和白彦虎。
384
在湘军的打击下，帕夏已经绝望，于5月份在喀喇沙尔服毒自杀。他的次子海古拉将他的尸体在水里浸泡三天，然后取出，裹上香牛皮，抬着西行。
海古拉一行走了五六百里，快到库车时，他哥哥伯克胡里派使者在途中拦截，杀死海古拉这个安集延人的小帕夏。
帕夏名叫阿古柏，自称毕调勒特汗，有六个儿子。长子哎哥，就是伯克胡里。阿古柏不喜欢他。次子海古拉。三子引上胡里。四子迈底胡里。其他两个儿子无名。
伯克胡里杀死海古拉以后，保守新疆南境，自封为王。安集延人和回民推举白彦虎率部防守喀喇沙尔西南部的库尔勒，白彦虎不听他们的安排，自己率部驻扎在开都河西岸，打算进入俄罗斯。
兵部右侍郎、钦差大臣郭嵩焘已于2月份抵达英国，觐见了维多利亚女王，并递交了国书。他受命在道歉之后，不用回国，就此出任驻英国公使。英国驻中国公使威妥玛趁机向清廷为安集延人说情，清廷将此事交给左宗棠办理。
左宗棠上奏说，立国就要有疆界，这是古今通义。必须根据时间与地点来统筹，才能权衡其中的轻重，建置也才会妥当。自古以来，中国边境遭到的侵扰，总是西北甚于东南。因为东南是以大海为界，有自然屏障，容易防守，西北则是一片无垠的广漠，能否防守，全看兵力强弱。兵少了，容易受到侵犯；兵多了，又耗费国家的财富。论防守，没有天险阻挡战马的铁蹄；论进攻，没有舟楫用来节省转运的费用。不像东南有天险可以凭借，办理军事比较容易。
左宗棠说，清朝定都北京，有蒙部环卫北方，一百几十年没有烽火报警。不但前代所说的九边都成了腹地，就连科布多、乌里雅苏台以至张家口，也分别驻扎了部队戍守，了望堡遥遥相通，国都一带十分平安。这是因为祖宗朝削平了准部，连带平定了回部，开辟新疆，设立军府的结果。因此，注重新疆，是为了保卫蒙古，保卫蒙古，是为了保卫京师。如果新疆不能稳固，蒙古就会不安，不但陕西、甘肃