，并省官员之大事就顺利平稳地完成了。两人办完这件事情，即开始着手整理尚书省内部庶务。
他俩召来六部尚书、侍郎，询问他们如何整顿厘改庶务。大部分人面露难色，不肯言语。户部尚书裴矩说道：“此次并省之后，户部留任人员不及原来的三分之一。下官这几日一直夜不能寐，整天盘算着如何调理人手。唉，原来的事情一点都没少，可人员一下子少了那么多，不由得手忙脚乱。现在若再让厘改庶务，时间是不是有点太仓促了？能否过上一段时间再说？”大部分的尚书和侍郎显然赞同裴矩的话，缓缓点头。
杜如晦听后立刻给挡了回去：“今天召集你们来，不是议论做与不做，而是如何来做！以前人多之时，是因人设事；此次并省之后，就要因事设人。以前多次说过让你们行并省之事，皆被你们以各种理由推搪下来；现在并省已毕，若按以前的老套路运作，那前面的劳作岂非都白费了？”杜如晦任兵部尚书时，行事雷厉风行，干练有度，同僚之中皆以强硬誉之。
房玄龄说道：“皇上亲口对本官说过，官在得人，不在人多。尚书省执掌总领百官、仪刑端揆，上下传达之通畅为首要。此次并省之后，留任者相对都是一些干练之人，可使他们一专多能，使类似的活儿兼并在一起，即可提高处理庶务的效能。至于如何运作，我和杜仆射商量过了，十日内由各部拿出预案。经过核查后，即予施行。”房玄龄平素儒雅谦和，像这样掷地有声的话语并不多。
李靖新任兵部尚书，对房杜两人大刀阔斧厘改吏治的做法由衷地赞成。有唐以来，似李靖这样军机冠盖天下者，实为第一人，其洞察时事与前瞻将来之能亦为超绝。他伸手从袍袖中抽出一卷文册，将之递给杜如晦，说道：“所幸杜仆射为下官的前任，兵部厘改已久，李靖此来倒是捡了一个现成的便宜。杜仆射，这是下官令人拟出的一份草稿，就兵部人员设置及职能，还有庶务办理之程序，大致做了些说明。不知道能否以为预案之用？”
杜如晦展开一看，只见其中所列甚详。全卷共分为四章：一曰人员构成，包括尚书、侍郎在内，兵部仅设属官二十三人；二曰职掌范围；三曰办事程序，其中如移文一节，皆规定了详细的时间；四曰应急预案。杜如晦看完后将之交给房玄龄，说道：“人言李药师能卜先机，我今日算是开了一次眼。不错，我所说的预案就是这样。总而言之，京城百官经过并省之后，设法提高办事能力，使政令畅达，人倍其能，即是此次厘改的主要目的。人言上行下效，我们这样做，相信下面的州县也不能无动于衷。”
褚亮点点头，说道：“杜仆射，等一会儿请将兵部的预案让下官一观。此次房杜仆射行并省之事，再厘改吏治，说来其中多是吏部的事务。唉，吏部今后定当知耻而后勇，说什么也不能落在后头。”
杜如晦微微笑道：“褚先生以前多掌文学之职，此次入主吏部，皇上其实最重你的‘廉直’一节。我们现在行并省，搞厘改，仅仅是表面的事情。我们要赶快将这两件事情做完，然后将之更好地服务于皇上的旨意。像户部，须以兴农为第一要务，今年天旱少雨，又生蝗灾，如何保证秋收，减少损失，就看户部如何协调地方了。另外，皇上说过要选用良吏，无非有两条途径：一在现任吏员中发现，二通过科举铨选以随才授任。褚先生，今后的吏治如何，关键就要看吏部如何识人。”
褚亮连连摇手，说道：“慧眼识人不是下官的长处，房杜二仆射多年来随皇上阅人无数，我只可为辅助。”
房玄龄眼光离开文册，对大家说道：“就这样吧，大家可依兵部此例交来预案。我原来想限为十日以内，现在看来时间太长，那就五日吧。”
房玄龄、杜如晦入主尚书省之后，这里顿时面貌一新。两人勤劳理政，处事公正且铁面无私。他们一心扑在尚书省的事务上，往往通宵达旦，等闲难得回家一回。有时候忙起来，他们甚至将到政事堂参加宰相议事例会的事儿都忘得无影无踪。
政事堂设在门下省，是宰相办事的处所，例由中书令负责召集宰臣议事。李世民在听朝之余，常常爱去两个地方：一个是东宫的弘文殿，他到这里多与饱学学士商榷史事，以为今用；还有一个地方即是政事堂，他到这里多与宰相们商议国家大事。
按唐制度，三师（太师、太傅、太保），三公（太尉、司徒、司空）皆为宰相；三省长官共议国政，亦为宰相职。然三师、三公现多阙员，眼下仅有裴寂为司空，而李世民只让裴寂有一个司空的名分，却不许他参与朝政来政事堂议事。经常来此议事者，计有门下省侍中高士廉，中书省中书令温彦博，尚书左右仆射房玄龄、杜如晦，最近又新加上长孙无忌和魏征，共有六人。
这日散朝之后，温彦博、高士廉、长孙无忌、魏征依例入了政事堂，然左等右等不见房玄龄和杜如晦前来。原来他们两人下朝后直接奔向尚书省，显然忘了这码子事。发生这样的事情已经不是第一回了，负责召集宰臣议事的温彦博，知道他们未来的原因，一面打发人去尚书省催请，一面不满地嘟囔道：“既然位居宰辅，当思天下之事。他们这样整日想着本省的事务，干脆别当这个宰臣了。”
这日的议题是绵州等地报来开挖河渠的奏折，李世民鉴于隋炀帝开挖运河的遗祸，对此事极为慎重，嘱咐政事堂议论后再决。房玄龄和杜如晦是此事的正主儿，他们不来，此事无法开议。几个人只好相对而坐，随便说些闲话。
魏征最先开言：“这两位仆射到任后，终日忙忙碌碌，说来还是有些效果的。我这些日子明察暗访，觉得吏治之风确实有所变化。他们两人在那里铁面无私，且处事公平，不喜下面贪墨阿私，溜须拍马，下面的人眼见这样，只好收起短处，勤勉办事。以前诸省中以尚书省最有油水可捞，其风气未免不正。现在他们致力于吏治，确实起到了立竿见影的效果。”
长孙无忌笑道：“人言魏大夫眼光准鼻子灵，果如其然。要说这监察百官的事儿，是御史台的职责。你这样忙碌，就不怕别人说你的手伸得过长吗？”
这时听见外面有人接话：“谁的手伸得太长呀？”话音未落，就见李世民已经跨入堂内。
几个人急忙立起身来迎候。原来李世民有话，他若到了政事堂，诸人不用再行跪拜之礼。
大家坐定后，长孙无忌将刚才与魏征的对话说给李世民听。
李世民听到长孙无忌说魏征的鼻子灵，忽然想起自己面对长孙嘉敏时骂魏征的话，不禁“扑哧”一笑，马上又转入正色道：“魏卿如此，好呀。朕昨日看到裴矩上了一份奏折，是谏朕之失的。这份奏折说来也和魏卿、玄龄、如晦都有些干系。”
原来李世民患于官吏贪墨成风，即让常何派宿卫扮成各色人到各司办事，并试着贿赂那些经办人员。户部的一名门令答应通融，悄悄受绢一匹。李世民闻知此事，即令将此人处死。裴矩作为户部尚书，很快知道了此事的始末，遂上疏道：“为吏受赂，罪诚当死；但陛下使人遗之而受，乃陷人于法也，恐非所谓‘道之以德，齐之以礼’。”李世民阅罢觉得有理，遂令人将此名门令放还本职，责令裴矩重重诫勉其一番，不再治其罪。
李世民将过程大致说了一遍，然后说道：“这件事儿和魏卿的干系，就在于魏卿开了谏诤的先声，裴矩虽不在谏官之列，闻朕之过即来谏之。朕记得魏卿以前也曾经谏朕要以诚信待人，朕派人密赂官吏，即为诈也，步了曹孟德后尘。由此观之，魏卿与裴矩皆守了一个‘理’字。至于和玄龄、如晦的干系，正如魏卿所言，他们整饬了尚书省的吏风，使人尽以公心办事而已。像裴矩这样的人，他在前隋时候惯会见风使舵，到了我朝竟然变得忠直，委实不容易呀。裴矩能有今日，确实受了众卿的影响。”
众人听后觉得很有道理，高士廉说道：“陛下其实自谦了，百官如此，盖因君主首善。岂不闻‘君恶闻其过，则忠化为佞；君乐闻直言，则佞化为忠’这句话吗？裴矩所以佞于隋而忠于唐，非其性子有什么变化，只是因为君主不同罢了。”
李世民不免有些得意，目视魏征道：“魏卿，你以为呢？”
魏征点点头，说道：“高侍中所言，臣也是这样以为的。只不过为政之道，不可浅尝辄止，更不能见到一点效果就沾沾自喜。圣人所以说居安思危，正为此也。陛下，眼下的治化刚刚开始，还不是高兴的时候。”
李世民的一团高兴被魏征的这番话打消下去，神情不免难堪。不过他最近多经历这样的场面，尤其在魏征面前已经习以为常，就很快地调整了神态。恰在此时，房玄龄和杜如晦迈入堂来，他们见李世民坐在堂上，急忙躬身施礼。
李世民微微皱了一下眉头，一面招呼两人坐下，一面说道：“玄龄、如晦，你们两人平时是最有章法之人，缘何就忘了来这里议事？听温卿讲，你们这也不是第一回了。你们既然位列宰辅，须以天下事为己任，不能天天陷身于尚书省的事务堆里，这样不好。”
房玄龄小心答道：“皇上所责甚是，只不过臣与如晦刚刚入主尚书省，诸事忙乱，一时理不清头绪。”“不错，朕看你们确实忙昏了头。你们既为仆射，当广求贤人，随才授任，这也是你们做宰相的主要职责。朕听说你们每每听受辞讼，竟然日不暇给乐此不疲，还有时间替朕求贤吗？从今日开始，有关尚书省的细务可交尚书左右丞处理，唯大事及其他当奏者，方容你们过问。”
房玄龄和杜如晦急忙站起，齐声答道：“臣遵旨。”
李世民挥挥手，说道：“言归正传，赶快议事。”
各地此次报来的兴修水利项目，计有虢州欲修弘农渠，福州欲修材塘，绵州欲修折脚塘和云门堰，并州欲修栅城渠。这些工程量其实都不大，只不过今年以来李世民多次诏令不许滥征民力，各州刺史极为慎重，不敢擅专，因报来请朝廷示下。
温彦博简略地将以上工程叙述了一遍，然后抬头征询大家的意见。
房玄龄说道：“今年天遭大旱，田亩无水，禾苗饥渴。我看了各州报来的情况，北方的冀、魏、齐、郑、汴、陈、亳诸州以及关中地区的旱情稍轻一些。究其原因，前隋所修下的运河等渠，使沿途百姓汲水方便，能够灌溉，才得以缓解灾情。兴修水利有利于农桑，只是眼下百姓凋敝，似以不征役为佳。”
长孙无忌笑道：“看来隋炀帝并非一无是处，他开挖了诸多河渠，虽使当世百姓蒙害，然对我朝有利。”
魏征不赞成长孙无忌的观点，驳道：“隋炀帝穷尽民力，其留下的运河正好作为一面镜子，以为鉴戒。岂能因获小利而沾沾自喜？无忌，我们位列宰辅，这样的念头一点都不能有。”
长孙无忌对曰：“魏大夫所说的都是圣哲大道，然眼下沿渠百姓皆蒙其利，这是事实啊！你总不能为了痛说隋炀帝之非，而将他留下的东西统统弃之不用，或者干脆将其开挖的沟渠再填起来。我欲兴农桑，除了以农为本以外，还要充分利用好前朝留下的东西，方为正理。像原来蜀郡太守李冰造的都江堰，至今还在使用，即为例证。”
魏征又好气又好笑：“我……我……什么时候说过要将沟渠填塞了？”
温彦博摇手道：“别扯远了，皇上在侧，还是要议正题。你们这样斗嘴，是宰臣之间说的话吗？”
李世民看到魏征那气急败坏的样子，不禁好笑。心想素来伶牙俐齿的魏征，遇到长孙无忌歪说其理，给闹了一个手足无措，实在有趣。
此后高士廉、杜如晦陆续发言，魏征和长孙无忌也说了自己的意见。这件事情并不复杂，三言两语就说出了大概。兴修水利可以排涝抗旱，又有舟楫之利，是百益无一害的事儿。只是眼前不能滥征民力，这就显得很矛盾。诸人议论罢，齐齐眼望李世民，由其一锤定音。
李世民心里已经有了主意，徐徐说道：“朕以前多次说过，致政须顾民心。兴修水利是为百姓谋利，不滥征民力也是体恤百姓，这两件事情都应该做。其实百姓农忙之时也是有时辰的，若其农闲之时也不能将时间荒废。此次兴修渠塘要改变以往的征役方式，可由当地官府召集所修渠塘能受益的百姓，先问明他们是否自愿出工修筑，若无阻碍，即可利用农闲时候开工。各州只要依此方法办理，不是强索民力，今后不用再报，即可便宜行事。你们若以为无不妥，就拟诏发下去吧。如晦，渠塘修筑时候，你要让户部派员下去明察暗访，防止州县官吏为出政绩，变着法儿滥征民力。唉，天下之大，不可放任不管呀。往往一道诏令下去，总有人变着法儿想对策。现在的吏治之风虽逐渐好起来，但也不能掉以轻心。”
李世民在堂上行了几步，转头又道：“大力兴修水利是不错的。天下山川纵横，雨水不均。今年天旱已久，有些地方颗粒无收；然将来也有暴雨成灾、大水泛滥的年份。现在国力有限，难以筹措大量人力、物力兴修水利。待将来有了积累，这件事情还是要做的。玄龄、如晦，户部的水部郎中和员外郎主持此事，要让他们立刻重新绘制天下的渠梁、堤堰、沟洫、运漕总图，将来在其紧要处逐年修建、疏通。隋炀帝修筑渠沟使我朝借利，然他当时好大喜功，幻想自己驾龙舟纵横天下，滥使了当时的民力、财力。这一点，朕任何时候均不会取之。兴修水利且修筑有度，此为朕之本意。”
议完了这些事情，李世民又将话题转到选才任能上。他说道：“玄龄、如晦，你们随朕多年，知道朕对举贤才的态度。当初朕令封德彝举才，然他许久未荐一人，并说天下无才可荐。朕当时就呵斥了他，须知天下并非无良才，惜未被发现或者人未尽其才。你们两人现在主事尚书省，朕刚才说了，要将一应庶务付与左右丞办理，把你们的精力放在选贤任能上。还有，原来吏部侍郎刘林甫曾奏选人要四时听选，随阙注拟，朕也准了。